在公司治理中，股东会中的表决权如何保证公平是一个备受关注的问题。股东作为公司的出资者，依法享有表决权。然而，由于股东持股比例不同，可能出现大股东“一股独大”的局面，导致小股东权益受损。因此，合理设置和科学运用表决权是确保股东利益平衡的关键。

首先，按照出资比例行使表决权是最基本的原则。在有限责任公司中，通常采用“一股一票”或“按出资比例投票”的方式。这种方式能够体现股东的投资权重，确保大股东在决策中有足够的话语权。然而，单一的比例表决容易造成大股东独断专行，因此在公司章程中设置特别决议机制尤为重要。

其次，可以在公司章程中规定某些重大事项需要特别多数决议，例如公司合并、分立或解散等。要求三分之二或更高比例的股东同意，能够有效避免大股东通过简单多数操控公司事务。这种机制不仅维护了中小股东的权益，还能促使公司决策更加慎重。

此外，累积投票制是保护中小股东权益的一种有效方式。在选举董事或监事时，允许股东将所持票数集中投给一个候选人，有助于小股东在董事会中获得代表席位，从而实现利益平衡。

在实际操作中，为了进一步提升公平性，公司还可以建立股东权益保护机制，包括知情权和异议权的保障。一旦发现表决权受到侵害，股东可以依法提起诉讼，寻求司法救济。

天津和然律师事务所提醒，公司在制定章程时应充分考虑表决权的公平性，避免单一股东权力过于集中。通过合理的制度设计和平衡机制，不仅能增强公司治理的民主性，还能有效维护各方股东的合法权益。如果在实际操作中遇到股东权利受损问题，建议及时咨询专业律师，依法保障自身权益。