在公司经营陷入困境、资不抵债时，公司在破产中的清算程序如何合法执行，是企业管理者和债权人关注的焦点问题。依法进行清算，不仅能保障债权人的合法权益，还能确保破产程序的规范和公正。那么，公司在破产清算中应如何合法执行呢？

首先，公司应当依法向法院申请破产清算。破产申请可以由债务人或债权人提出，法院受理后，将指定管理人负责资产清算。管理人通常是专业的清算团队或律师事务所，负责对公司资产进行全面调查、清点和评估。

其次，管理人在接管公司资产后，应当及时编制资产负债表和财务状况报告，并组织召开债权人会议。在会议上，债权人有权对债务清偿方案进行表决，同时监督清算工作的合法性和透明性。

在清算过程中，资产处置是重中之重。管理人应当依法变卖公司资产，将所得资金用于偿还债务。清偿顺序按照法律规定进行，首先支付破产费用和共益债务，其次是职工工资和社会保险费用，然后是税款，最后才是普通债权人的清偿。

对于公司股东而言，如果在公司清算时发现存在财务造假或非法转移资产的行为，股东可能面临法律追责。因此，公司管理者在破产清算中应严格遵循合法性和公正性原则，避免个人责任牵连。

清算完毕后，管理人需编制清算报告并提交法院，由法院裁定破产程序结束。企业注销登记后，公司法人资格正式终止。

天津和然律师事务所提醒，企业在破产清算时，要严格按照法律程序操作，确保清算工作公开、公正和透明。如遇复杂问题，建议聘请专业律师协助清算，避免因操作不当引发法律纠纷或个人责任风险。